A Baixa da Banheira situa-se entre as vilas de Alhos Vedros e Lavradio que lhes ficam a nascente e poente respetivamente. A norte é banhada pelo estuário do Tejo, numa enorme reentrância que se estende do Bico da Passadeira (Barra-a-Barra) até à vila da Moita e a sul a extrema do concelho com o do Barreiro.
Os limites da Freguesia são, a Norte, o caminho municipal, Avenida 1.º de Maio e o limite da Freguesia de Alhos Vedros, a Ponte, e a Sul a Freguesia é limitada pela Fronteira dos Concelhos da Moita e do Barreiro, a Nascente, Vale da Amoreira é limitada pela Freguesia de Alhos Vedros.
